給与支払明細書のレイアウトを変更することは、可能ですか？

はい、可能です。
表示項目数が可変のレイアウトのほか、表示項目数が固定のレイアウト(ＰＸ２と同様の
様式)のいずれかのレイアウトを選択できます。

なお、変更手順は以下のとおりです。
１．「設定」－「給与・賞与体系」－「給与体系」をクリックします。
２．給与体系の[給与明細様式]をクリックします。
３．左の一覧から「レイアウト」を選択し、[修正]をクリックします。
４．レイアウトを選択し、[ＯＫ]をクリックします。