２回目の申告でも、電子申告できます。
そのため、レポーティングパッケージを修正、再計算し、電子申告データを再作成後、再
作成した電子申告データに再度電子署名を行い、電子申告することになります。
なお、電子申告義務化対象外の場合は、２回目の申告について、電子申告せず、書面で提
出することもできます。
※国税ｅ－ＴａｘＨＰの関連Ｑ＆Ａ
［問］
当初、ｅ－Ｔａｘを利用して行った申告について、書面で修正申告をしてもよいのです
か。
また、逆も可能ですか。
［答］
当初、e-Tax を利用して行った申告について、書面で修正申告することは可能です。
また、逆に、書面で行った申告について、e-Tax を利用して修正申告することも可能で
す。
これは、e-Tax が利用者にその利用を義務付けるものではなく、書面による申告書等の
持参又は送付による提出方法に加え、電子データの形式でインターネットを通じて送信す
るという、新たな提出方法の選択肢を利用者等に提供するものであるためです。
（https://www.e-tax.nta.go.jp/toiawase/qa/yokuaru01/07.htm）