ご質問にある株主資本等変動計算書を読み込んだ場合、システムでは、「利益準備金」
は「繰越利益剰余金」の親科目と判断します。「利益準備金」の下に勘定科目があるため、
金額（ご質問にある「1,000」）は読み込まれません。
「利益準備金」が「繰越利益剰余金」の親科目とならないよう、「繰越利益剰余金」の
親科目（例：「その他利益剰余金」）を設定することで、「利益準備金」の金額が読み込
まれます。
(修正後のＣＳＶを読込んだ画面イメージ)
┌－－－－－┬－－－－－－－－┬－－－－－－－┬
｜利益剰余金｜ ｜利益剰余金合計｜
├－－－－－┼－－－－－－－－┼－－－－－－－┼
｜利益準備金｜その他利益剰余金｜ ｜
├－－－－－┼－－－－－－－－┼－－－－－－－┼
｜ ｜繰越利益剰余金 ｜ ｜
├－－－－－┼－－－－－－－－┼－－－－－－－┼
｜ 1,000｜ 20,000｜ 21,000｜
なお、ご質問の現象は、「利益準備金」に限らず同じ理由で他の科目でも発生します。
（ご参考）現象の解説
１．システムでは、株主資本等変動計算書を読み込む際、表示区分（勘定科目）の一つ上
の行の一番左にある勘定科目を、親科目と判断します。
下記の例では、「利益準備金」の親科目は「利益剰余金」。「繰越利益剰余金」の親
科目は「利益準備金」と判断します。
（例）
┌－－－－－┬－－－－－－－┬－－－－－－－┬
｜利益剰余金｜ ｜利益剰余金合計｜
├－－－－－┼－－－－－－－┼－－－－－－－┼
｜利益準備金｜ ｜ ｜
├－－－－－┼－－－－－－－┼－－－－－－－┼
｜ ｜繰越利益剰余金｜ ｜
├－－－－－┼－－－－－－－┼－－－－－－－┼
｜ 1,000｜ 20,000｜ 21,000｜
２．また、子科目がある勘定科目は、金額を読込ません。
３．これにより、「利益準備金」は子科目として「繰越利益剰余金」を持つため、結果、
その金額（ご質問にある「1,000」）は読み込まれません。