売掛入金機能で入金消し込みを行う前に、先に売掛金の入金仕訳を入力してしまいました。
　消し込みはできないのでしょうか？

　できます。
　売掛入金機能をご利用の場合、通常、入金消し込みから入金仕訳を自動計上します。
　先に入金仕訳を伝票画面等から入力した場合、以下の手順で入金仕訳を手入力した分
について消し込みできます。なお、この場合、自動仕訳は作成されません。
１．しっかり会計の「売掛入金」アイコン（ＦＸ２用かんたん請求の場合、ＦＸ２の
　「かんたん請求の売掛入金」ボタン）をクリックします。

２．請求先一覧画面が表示されます。先に入金仕訳を入力した請求先については、「注」
　欄に「●」が表示されます。
　　当該請求先の行を選択し、「F5入金消込」ボタンをクリックします。
　

３．入金消し込み画面が表示されますので、請求書ごとに入金額を入力して消し込みます。