休業手当を支給することになりました。ＰＸで用意されている「給与控除額」を休業手当
の項目として代用することは可能でしょうか？

　代用することは、お勧めできません。
　給与控除額の項目属性の以下の設定が、設定変更できないためです。
・所得税区分
・社会保険固変区分
・労働保険賃金区分

　休業手当を支給する場合の入力方法は、こちらをご参照ください。
　休業手当の項目属性の設定方法は、こちらをご参照ください。