支払管理機能の約定の設定で、例えば「５０万円までは全額預金振込、５０万円を超えた
場合は全額支払手形扱い」という設定は可能でしょうか？

　可能です。手順は次の通りです。
１．「資金管理」タブのメニュー「2 開始時：支払先の約定登録」を選択します。
２．該当する取引先を選択の上、［修正］ボタンをクリックします。
３．「約定」タブで「個別指定」を選択の上、「支払方法」欄で「金額で決定」を選択します。
４．お問い合わせのケースの場合は、次の通り設定します。
　　500,000円までの額　［預金振込］
　　500,000円超は全額　［手形振出］

　【「開始時:仕入先の約定登録」画面】